La MED propose des thématiques sur des domaines scientifiques et techniques variés. Ces thèmes sont des pistes qu'il convient d'adapter en fonction des volontés et des projets de l'enseignant, de la classe et de l'ampleur que nous voulons donner au projet. L'enseignant est à l'origine du projet, en maîtrise la préparation et le déroulement. Tout projet est donc conçu avec l'enseignant et toute activité est co-animée avec lui.

En fonction du projet et du thème retenu et défini dans le prolongement des disciplines enseignées, il peut être organisé des séances d'animations scientifiques se déroulant sur plusieurs semaines (en classe ou dans les locaux de la MED). Il peut s'agir de séances de deux ou trois heures en ateliers tournants, la durée et le nombre de ces ateliers sont en fonction du projet.

Ainsi, différents formules d'activités sont possibles : nous avons les projets d'écoles, les actions complémentaires, les classes à PAC ainsi que les classes sciences.